Научный семинар «Гемодинамика»

Научный семинар «Гемодинамика»
Руководитель: д.ф.-м.н. А. П. Чупахин

Пятница, 5 апреля 2019 г., 11:00, ИГиЛ СО РАН, ауд. 123

А. Ю. Пальянов (ИСИ СО РАН). Методы и алгоритмы для решения ряда актуальных задач в области вычислительной нейробиологии, биомеханики и молекулярной биологии (по материалам докторской диссертации)

Аннотация. Одной из важнейших проблем на стыке нейробиологии и информатики является исследование возможности воспроизведения нейроинформационных процессов, происходящих в нервной системе живого организма, в форме компьютерной симуляции. В докладе рассматриваются вопросы проектирования и программной реализации биологически обоснованной компьютерной модели (виртуального организма) нематоды C. elegans, которая для полноценного моделирования нервной деятельности должна включать комплекс из взаимодействующих между собой сенсорной, нервной и мышечной систем, а также симулятор тела и фрагмента виртуального мира с действующими физическими законами.

Для решения задачи 3D моделирования биомеханики движения тела C. elegans в контакте с различными объектами, включая жидкости, гель и твердые тела, в Лаборатории моделирования сложных систем ИСИ СО РАН была разработана специализированная среда моделирования Sibernetic (Palyanov et al., 2016; Palyanov et al., 2018) с использованием высокопроизводительных параллельных вычислений на GPU. В работе также рассматриваются задачи определения параметров движения и мышечной активности реального C. elegans на видеозаписях; проблемы численного моделирования активности нервных и мышечных клеток, включая модели ионных каналов; методы моделирования и анализа структурной динамики белковых молекул, а также ряд других вопросов.